数据整合:直接将UKBOlink蛋白组学数据与您的Olink蛋白质数据相结合,为您的研究发现提供支持。
研究方法
本研究是当前在血浆蛋白质组领域,尤其是在健康与疾病研究中规模最大的项目之一,揭示了大量关联性,提升了蛋白质诊断和预测模型的性能。我们确定了因果蛋白质和治疗靶点,并构建了公开资源,以促进临床策略的发展。系统性整合健康与疾病谱,深入探讨蛋白质功能、因果关系以及治疗潜力,基于蛋白质组聚类推动对疾病分类和发病机制的新理解。
应用二:数据验证
研究方法包括探索蛋白质与缺血性心脏疾病(IHD)及其风险因素之间的关系:361种蛋白质与IHD显著相关,其中部分为已知的标志物,如NT-proBNP等。经过风险因素的调整,这些蛋白质仍展现出稳健的关联性,且它们之间相关性适中。
在遗传关联分析中,361种蛋白质中有212种在中国健康人群(CKB)中存在cis-pQTLs,孟德尔随机化(MR)分析确定了13种具有潜在因果关系的蛋白质。在欧洲人群中,307种蛋白质有cis-pQTLs,其中16种与IHD显著相关,4种在中欧人群中得到了验证。
针对潜在靶点的下游分析,例如FURIN等13种蛋白质,通过表型关联、基因敲除及富集分析,证明其在心血管疾病(CVD)病理生理过程中的关键角色。其中部分蛋白质已经有药物研发进展,而有些则需要深入探索。
我们常被咨询关于比较不同队列数据的最佳方法。一种途径是纳入重叠或桥接样本,或者在队列之间设立一个共同组,以消除批次效应。这一方法的一大优势是可以使两个队列保持一致,进而对大型数据集进行处理和分析。然而,当深入了解队列的生物学特性时,也需注意众多可能影响数据动态变化的因素。与DNA相比,蛋白质的动态性更强,受多种不同因素的影响,从样本采集的时间到样本制备过程再到后续处理,这些因素都可能在不同程度上对数据分析和理解构成挑战。
数据库访问申请流程
注册用户需通过访问管理系统(AMS)申请数据库访问,并准备研究概要、所需UKB数据字段和研究可能产生的新数据或变量描述等资料。申请步骤包括:
- 在UKB在线访问管理系统中填写申请表并选择数据层级。
- 将访问UKB数据的研究人员添加为合作者。
- 提交签署材料转让协议(MTA)所需的签字人联系信息,此人不得是每个机构的首席研究员/主要合作者。
- UKB团队将审核申请,并通过AMS中的消息提供反馈。
- 若申请获得批准,将提出访问费用请求,并发送MTA给申请者及其授权签字人。
Olink蛋白质组学数据包含在UKBTier3类型中(包括其他多组学数据),标准费用为9000英镑。